五更腹泻的药物治疗需要辨证论治。目前最常用的药物有四神丸、人参健脾丸、理中丸等。另外,经过药物治疗症状缓解后,还需要注意饮食,在日常生活中应清淡、易消化,避免生冷刺激食物,或精神紧张,避免再次诱发腹泻的发作;另外,中医有通泻要方,常用于治疗五更泻。